HAV710V Functional Genomics
Responsable
Crédits : 5 ECTS
Présentation
L’UE a pour but de présenter les technologies de génomique fonctionnelle en -omique, et d’exposer des exemples de questions biologiques qui peuvent être posées grâce à elles. Les cours sont assurés par des enseignants-chercheurs et des chercheurs.
Presentation
This unit aims to present « omics » functional genomics technologies, and some biological questions that they can address. The lectures are given by both associate professors and researchers.
Description
Introduction à la génomique fonctionnelle: approches, concepts et méthodes
An introduction to functional Genomics: approaches, concepts and methods
– V. Coulon, UM / IGMM
Organisation des génomes / Genome organisation
Techniques de séquençage / DNA sequencing methods L. Journot, IGF
Organisation 3D des génomes / 3D genome organisation J. Poli, UM / IGH
Organisation topologique et réplication des génomes / Genome topological organisation and replication – V. Coulon, UM / IGMM
Régulation spatio-temporelle de l’expression des génomes / Spatio-temporal regulation of gene expression
Transcription
Epissage / Splicing
– V. Coulon, UM / IGMM
ARN non-codants / non-coding RNAs
V. Coulon, UM / IGMM
Interactomique / Interactomics
Ian Robbins, UM / IGMM
Protéomique et pharmacogénomique / Proteomics and Pharmacogenomics
C. Bécamel, UM / IGF
Modèles animaux / Animal Models
Utilisation de la souris en génomique fonctionnelle / Using Mice in Functional Genomics F. Poulat, IGH
La Drosophile en génomique fonctionnelle / Using Drosophila in Functional Genomics – F. Juge et S. Chambeyron, IGH
Analyse et présentation d’articles scientifiques/ Scientific articles analysis and presentation (15min + 10 min de discussion par groupe de 3 étudiants)
Objectifs
– Approfondir les bases moléculaires de grands mécanismes de génomique/épigénomique fonctionnelle : réplication, transcription, régulations post-transcriptionnelles
– Introduction à la génomique fonctionnelle :approches, outils, concepts et limites
– Modèles animaux (souris, drosophile) et techniques de transgénèse
– Analyse critique de résultats de génomique fonctionnelle
Pré-requis nécessaires
1. Formation de niveau licence en biologie moléculaire et cellulaire
BSc level in cellular and molecular biology
2. Maîtrise correcte de l’anglais (majorité des cours et totalité des articles scientifiques donnés en anglais)
Good english language skills, as most of the lectures and all of the articles are in this language.
Pré-requis recommandés
-Bon niveau en biologie moléculaire
Good knowledge of molecular biology
Modalités de contrôles des connaissances
Examen final : 70% (ou 100%) de la note . Analyse de figures, questions de synthèse de cours ou choix de techniques pour répondre à une question biologique donnée…
Final exam : 70% (or 100%) of your mark. Figure analysis, synthesis questions or pairing techniques with biological questions…
Présentation d’articles : 30% de la note si supérieure à celle de l’examen final.
Article analysis and presentation : 30% of your mark if above the final one.