HAV5810V Functional Genomics
Responsable
Crédits : 5 ECTS
Intervenants
V. Coulon
C. Becamel
L. Journot
E. Soler
F. Poulat
F. Juge
S. Chambeyron
Description
L’UE a pour but de présenter les technologies de génomique fonctionnelle en -omique, et d’exposer des exemples de questions biologiques qui peuvent être posées grâce à elles. Les cours sont assurés par des enseignants-chercheurs et des chercheurs.
Introduction à la génomique fonctionnelle : approches, concepts et méthodes
Organisation des génomes
Techniques de séquençage
Topologie de la chromatine et pathologies
Organisation topologique et réplication des génomes
Régulation spatio-temporelle de l’expression des génomes
Transcription
Epissage
ARN non-codants
Protéomique et pharmacogénomique
Modèles animaux
Utilisation de la souris en génomique fonctionnelle
La Drosophile en génomique fonctionnelle
Analyse et présentation d’articles scientifiques
(15min + 10 min de discussion par groupe de 3 étudiants)
Description
This unit aims to present « omics » functional genomics technologies, and some biological questions that they can address. The lectures are given by both associate professors and researchers.
An introduction to functional Genomics: approaches, concepts and methods
Genome organisation
DNA sequencing methodsL
Chromatin Topology and Pathology
Genome topological organisation and replication
Spatio-temporal regulation of gene expression
Transcription
Splicing
non-coding RNAs
Proteomics and Pharmacogenomics
Animal Models
Using Mice in Functional Genomics
Using Drosophila in Functional Genomics
Scientific articles analysis and presentation
Objectifs
– Approfondir les bases moléculaires de grands mécanismes de génomique/épigénomique fonctionnelle : réplication, transcription, régulations post-transcriptionnelles
– Introduction à la génomique fonctionnelle :approches, outils, concepts et limites
– Modèles animaux (souris, drosophile) et techniques de transgénèse
– Analyse critique de résultats de génomique fonctionnelle
Pré-requis nécessaires
Formation de base en biologie moléculaire et cellulaire
Pré-requis recommandés
Bon niveau en biologie moléculaire
Good knowledge of molecular biology
Modalités de contrôles des connaissances
Examen final : 70% (ou 100%) de la note. Analyse de figures, questions de synthèse de cours ou choix de techniques pour répondre à une question biologique donnée…
Présentation d’articles : 30% de la note si supérieure à celle de l’examen final.
Final exam : 70% (or 100%) of your mark. Figure analysis, synthesis questions or pairing techniques with biological questions…
Article analysis and presentation : 30% of your mark if above the final one.