HAV5810V Functional Genomics

Responsable

Vincent Coulon

Crédits : 5 ECTS

Intervenants

V. Coulon

C. Becamel

L. Journot

E. Soler

F. Poulat

F. Juge

S. Chambeyron

Description

L’UE a pour but de présenter les technologies de génomique fonctionnelle en -omique, et d’exposer des exemples de questions biologiques qui peuvent être posées grâce à elles. Les cours sont assurés par des enseignants-chercheurs et des chercheurs.

Introduction à la génomique fonctionnelle : approches, concepts et méthodes

Organisation des génomes

Techniques de séquençage

Topologie de la chromatine et pathologies

Organisation topologique et réplication des génomes

Régulation spatio-temporelle de l’expression des génomes

Transcription

Epissage

ARN non-codants

Protéomique et pharmacogénomique

Modèles animaux

Utilisation de la souris en génomique fonctionnelle

La Drosophile en génomique fonctionnelle

Analyse et présentation d’articles scientifiques

(15min + 10 min de discussion par groupe de 3 étudiants)

Description

This unit aims to present « omics » functional genomics technologies, and some biological questions that they can address. The lectures are given by both associate professors and researchers.

An introduction to functional Genomics:  approaches, concepts and methods

Genome organisation

DNA sequencing methodsL

Chromatin Topology and Pathology

Genome topological organisation and replication

Spatio-temporal regulation of gene expression

Transcription

Splicing

non-coding RNAs

Proteomics and Pharmacogenomics

Animal Models

Using Mice in Functional Genomics

Using Drosophila in Functional Genomics

Scientific articles analysis and presentation

Objectifs

– Approfondir  les bases moléculaires de grands mécanismes de génomique/épigénomique fonctionnelle : réplication,  transcription, régulations post-transcriptionnelles

– Introduction à la  génomique fonctionnelle :approches, outils, concepts et limites

– Modèles animaux (souris, drosophile) et techniques de transgénèse

– Analyse critique de résultats de génomique fonctionnelle

Pré-requis nécessaires

Formation de base en biologie moléculaire et cellulaire

Pré-requis recommandés

Bon niveau en biologie moléculaire

Good knowledge of molecular biology

Modalités de contrôles des connaissances

Examen final : 70% (ou 100%) de la note. Analyse de figures, questions de synthèse de cours ou choix de techniques pour répondre à une question biologique donnée…

Présentation d’articles : 30% de la note si supérieure à celle de l’examen final.

Final exam : 70% (or 100%) of your mark. Figure analysis, synthesis questions or pairing techniques with biological questions… 

Article analysis and presentation : 30% of your mark if above the final one.