HAV909V TC1 : Information génétique-épigénétique-bases mécanistiques – Genetic-Epigenetic Information and their mechanical bases

Responsables

Michel Koenig

Jérôme Poli

Crédits : 5 ECTS

Intervenants

Michel Koenig

Jamel Chelly

Robert Feil

Frédéric Bantignies

Etienne Schwob

David Lleres

Dominique Helmlinger

Jérôme Poli

Constance Alabert

Objectifs

La spécialité a pour objectif de former les étudiants à appréhender les mécanismes génétiques et épigénétiques depuis la molécule jusqu’à l’organisme en son entier, dans ses états normaux et pathologiques, à la fois dans des organismes modèles et dans le contexte de pathologies humaines.

Les enseignements apporteront les bases mécanistiques, les stratégies de recherche et les outils technologiques requis pour développer un projet de recherche en génétique et épigénétique.

Objectives

The TC1 teaching unit aims to give students an overview of recent developments in the field of genetics and epigenetics, ranging from molecular insights to a whole-organism perspective. During the course, we will cover both physiological and disease contexts in human and model organisms.

The classes are generally organized as 3h lectures given by experts in their field of research. In the first hour, the lecturer will introduce basic concepts needed to understand the object(s) of study and then will illustrate strategies and tool setup in their lab to unravel a given biological process. The end of the class is devoted to student/lecturer discussion. We strongly encourage students to interact with the lecturer (about science, daily life in the lab, careers, labs,…).

Description

Révolution du programme génome humain:

  • Analyse familiale : études de liaison génétique
  • Séquençage à haut débit et identification des gènes de maladies
  • Maladies par mutations de novo germinales et somatiques : stratégie d’analyse

Révolution de l’épigénome – héritage épigénétique

  • Méthylation de l’ADN, empreinte génomique et maladies épigénétiques
  • Modifications de la chromatine : les marques d’histones
  • Architecture du génome : intégration de la fonction génomique et de l’architecture nucléaire
  • Réplication de l’ADN : intégrité de la transmission de l’information génétique et épigénétique
  • ARN non codants : contrôle de l’état d’activation des gènes
  • Régulation épigénétique : la levure comme modèle d’étude

Description

Core classes will cover the following themes :

  • The Human Genome Project for the identification of monogenic and multifactorial disease genes (human genetics), genetic linkage (human genetics)   
  • Applications to neurogenetics
  • The epigenome : writers, erasers and readers
  • Epigenetic inheritance
  • Faithful genome and epigenome duplication and transmission
  • DNA methylation : genome imprinting and epigenetic diseases
  • 3D genome organization in the nucleus: impact on genome expression
  • Non-coding genome and epigenetic regulation of genome expression
  • Pervasive genome expression : mechanisms to keep transcription in check

Observation

Chaque intervention de 3h débute par un cours, se poursuit par un séminaire de recherche et s’achève par un temps de questions/réponses autour d’un aspect particulier abordé au préalable par l’intervenant. Ce dernier pourra proposer aux étudiants un article de recherche en amont du cours.

Les interventions sont toutes en anglais. Les examens sont disponibles à la fois en français et en anglais (à l’exception de l’article sur lequel porte une partie de l’examen qui ne sera qu’en anglais).

Remarks :

Lectures are in English. Students can interact in French or English. Exams are in French and English (except for scientific articles that will only be in English).

Modalités de contrôles des connaissances

Écrit 100%

Session 2 : écrit